Crie o arquivo cmaptools.desktop e inserir linhas abaixo dentro do arquivo
[Desktop Entry]
Name=cmaptools
Comment=Inicia o aplicativo cmaptools
Exec=/home/usuario/cmaptools/CmapLite
Icon=/usr/share/icons/amusement_sections.png
Terminal=false
Type=Application
Encoding=UTF-8
Categories=Application;Education;
digitar estes comando no xterm
su
positivo
cd /usr/share
chmod 777 applications
e depois salvar o cmaptools.desktop na pasta /usr/share/applications
vai aparecer o cmaptools na barra de menus - Educação